RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

BASIC

Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 NR5A2O00482 541 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CTDSP2O14595 271 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 P4HA2O15460 535 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 XRCC3O43542 346 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TIMM44O43615 452 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PI15O43692 258 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ECE2O60344 883 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PRAMEF11O60813 436 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PRDM1O75626 825 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ATP6AP2O75787 350 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TSPAN9O75954 239 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 DFFBO76075 338 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 BEST1O76090 585 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 MTA2O94776 668 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 AP2A2O94973 939 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CELF2O95319 508 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 IGKV3-20P01619 116 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 IGHV2-70P01814 119 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 DNTTP04053 509 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TFAP2AP05549 437 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 H1F0P07305 194 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CD48P09326 243 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CLTBP09497 229 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF883P0CG24 379 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 KRT3P12035 628 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 AKR1B1P15121 316 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CEBPBP17676 345 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CYP2A7P20853 494 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 NFKBIAP25963 317 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PTPN3P26045 913 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 MC5RP33032 325 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ACTN2P35609 894 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 KRT2P35908 639 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PEX5P50542 639 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ASCL1P50553 236 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 VAMP7P51809 220 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 STAT2P52630 851 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CDH13P55290 713 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 MAZP56270 477 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 SNX16P57768 344 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CSNK2BP67870 215 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 KRT83P78385 493 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PDE1BQ01064 536 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 LGALS3BPQ08380 585 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF415Q09FC8 603 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 HYAL1Q12794 435 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CHAF1BQ13112 559 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ITGADQ13349 1161 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CUL3Q13618 768 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TUBB2AQ13885 445 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF273Q14593 569 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 PTPRCAPQ14761 206 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TNIP1Q15025 636 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 HERC3Q15034 1050 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 EXT1Q16394 746 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TAZQ16635 292 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 MEP1AQ16819 746 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 UGP2Q16851 508 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CDO1Q16878 200 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 DUOXA1Q1HG43 343 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 CCDC96Q2M329 555 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 GPR33Q49SQ1 333 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM35AQ53FP2 167 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 SLC25A53Q5H9E4 307 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TCP11X2Q5H9J9 407 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 C9orf152Q5JTZ5 239 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ELFN2Q5R3F8 820 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 C6orf136Q5SQH8 315 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 LCE3EQ5T5B0 92 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ALS2CLQ60I27 953 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 UGT3A1Q6NUS8 523 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 KLC3Q6P597 504 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 FIGLAQ6QHK4 219 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 TMCO3Q6UWJ1 677 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 KCTD8Q6ZWB6 473 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 BTN2A1Q7KYR7 527 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 GSTA5Q7RTV2 222 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 GPR141Q7Z602 305 aa0.4□□□□□ -2.35
SNORD71-201ENST00000411292 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms