RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.43□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf74A8MZ97 194 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 BTN3A3O00478 584 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PFDN6O15212 129 aa7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.43□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CT55Q8WUE5 264 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ASZ1Q8WWH4 475 aa7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 NAT9Q9BTE0 207 aa7.42□□□□□ -1.22
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