RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 CD1EP15812 388 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 EPORP19235 508 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ITGAXP20702 1163 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC25A3Q00325 362 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RIPK1Q13546 671 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CCINQ13939 588 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PTK2BQ14289 1009 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NFE2L1Q14494 772 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 INPP5AQ14642 412 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MAP7D1Q3KQU3 841 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 XKR5Q6UX68 686 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GK5Q6ZS86 529 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C11orf96Q7Z7L8 435 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 HOMEZQ8IX15 550 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 OR2T11Q8NH01 316 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 HMGCLL1Q8TB92 370 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 FOXJ1Q92949 421 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RCN3Q96D15 328 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 LRCH3Q96II8 777 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MRGPRX1Q96LB2 322 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CCDC138Q96M89 665 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 LGR4Q9BXB1 951 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC29A3Q9BZD2 475 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DPEP2Q9H4A9 486 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 DNAJC11Q9NVH1 559 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MMP17Q9ULZ9 603 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 OR1A2Q9Y585 309 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 FFAR3O14843 346 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 AIM2O14862 343 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GPR42O15529 346 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PEX11AO75192 247 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CLDN9O95484 217 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ATP6V1G2O95670 118 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C7P10643 843 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 IDO1P14902 403 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NDUFV2P19404 249 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ITPKAP23677 461 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 IGFALSP35858 605 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ACADVLP49748 655 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 AGKQ53H12 422 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RNF165Q6ZSG1 346 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SPATA19Q7Z5L4 167 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 FAM124AQ86V42 546 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 AMZ2Q86W34 360 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ULK2Q8IYT8 1036 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MIER2Q8N344 545 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 OXR1Q8N573 874 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PYCR2Q96C36 320 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 HBEGFQ99075 208 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 THTPAQ9BU02 230 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC17A9Q9BYT1 436 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ATG10Q9H0Y0 220 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 KLQ9UEF7 1012 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RNF11Q9Y3C5 154 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.24□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SHISA7A6NL88 538 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 WFS1O76024 890 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C1orf105O95561 183 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TRIM23P36406 574 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RGS19P49795 217 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PPP2CBP62714 309 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ERVK-8P63133 956 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 PPP2CAP67775 309 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 RPA4Q13156 261 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TDGQ13569 410 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 ABRAXAS2Q15018 415 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NR6A1Q15406 480 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 SNCBQ16143 134 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GSTA3Q16772 222 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 CCSMST1Q4G0I0 132 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 GGTA1PQ4G0N0 100 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 NEK5Q6P3R8 708 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 AGTRAPQ6RW13 159 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 C16orf89Q6UX73 402 aa10.23□□□□□ -0.77
COPS2-201ENST00000299259 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms