RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222574.8

HBP1-201, Transcript of HMG-box transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HBP1, Length 2,829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBP1-201ENST00000222574 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CASS4Q9NQ75 786 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SMOXQ9NWM0 555 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SGCEO43556 437 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 AKAP10O43572 662 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 RAB7BQ96AH8 199 aa14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 OAZ2O95190 189 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CYP17A1P05093 508 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 HBQ1P09105 142 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SLC2A3P11169 496 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CHRM3P20309 590 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 HMGCLP35914 325 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 RNF4P78317 190 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CSHL1Q14406 222 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CCNJQ5T5M9 372 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TMEM135Q86UB9 458 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZNF597Q96LX8 424 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 KLHL15Q96M94 604 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 POMKQ9H5K3 350 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SDHDO14521 159 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CDK1P06493 297 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 YES1P07947 543 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 MAGEA12P43365 314 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ARSDP51689 593 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 DGKQP52824 942 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 RAC1P63000 192 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ERV3-1Q14264 604 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZNF544Q6NX49 715 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZYG11AQ6WRX3 759 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 LINC00523Q86TU6 105 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 MARVELD3Q96A59 401 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ASB4Q9Y574 426 aa14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 NIPSNAP2O75323 286 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 COX5BP10606 129 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CHRNA4P43681 627 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 LGALS3BPQ08380 585 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CYS1Q717R9 158 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 LHPPQ9H008 270 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PIF1Q9H611 641 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 E5RI56 91 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PCDHGA12O60330 932 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 AP2A1O95782 977 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TNNI3P19429 210 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 MATKP42679 507 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 REP15Q6BDI9 236 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 SETD4Q9NVD3 440 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 MBD2Q9UBB5 411 aa14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 PPP6CO00743 305 aa14.61□□□□□ -0.07
HBP1-201ENST00000222574 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms