RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197		C9J4A7	227 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	KPNA5	O15131	536 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDUFS3	O75489	264 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CREG1	O75629	220 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RECK	O95980	971 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	HBQ1	P09105	142 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRSS56	P0CW18	603 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	AGXT	P21549	392 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDHA2	P29803	388 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXN2	P32314	431 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPY2R	P49146	381 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTPA	P49638	278 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CT55	Q8WUE5	264 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TLR10	Q9BXR5	811 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL22	Q9GZX6	179 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CASS4	Q9NQ75	786 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAMA5	O15230	3695 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ISM1	B1AKI9	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197		E7EQ34	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTN3A1	O00481	513 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RFPL1	O75677	317 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ETS1	P14921	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAM	P19021	973 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMA3	P25788	255 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITGA1	P56199	1179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDK16	Q00536	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPESP1	Q6UW49	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SYVN1	Q86TM6	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRRC6	Q86X45	466 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MPP5	Q8N3R9	675 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	THAP4	Q8WY91	577 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOPNL	Q96NB1	174 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACTL8	Q9H568	366 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLMP	Q9H6B4	373 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	XKR8	Q9H6D3	395 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	BPTF	Q12830	3046 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SDK2	Q58EX2	2172 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	BTN3A3	O00478	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUV39H1	O43463	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	WISP1	O95388	367 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TIAF1	O95411	115 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ITGB6	P18564	788 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	F8A1	P23610	371 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPN4	P29074	926 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRIA1	P42261	906 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSRP3	P50461	194 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CASC4	Q6P4E1	433 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEX19	Q8NA77	164 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TCTN2	Q96GX1	697 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	LRFN5	Q96NI6	719 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		10.62	□□□□□ -0.71
NPIPB4-222	ENST00000614197	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71

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