RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRSS56P0CW18 603 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CDK4P11802 303 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 IMPDH2P12268 514 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 MSH3P20585 1137 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ITGALP20701 1170 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CASQ1P31415 396 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 HADHAP40939 763 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CTSCP53634 463 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCL7P80098 99 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SHC2P98077 582 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 XIAPP98170 497 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ILKQ13418 452 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 NFATC2Q13469 925 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PEX6Q13608 980 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ITGA9Q13797 1035 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CYP1B1Q16678 543 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SKIDA1Q1XH10 827 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 AMZ1Q400G9 498 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 C14orf28Q4W4Y0 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 LDLRAP1Q5SW96 308 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ANKRD22Q5VYY1 191 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CASC4Q6P4E1 433 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMEM220Q6QAJ8 160 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 C4orf22Q6V702 233 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRRTM4Q86VH4 590 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SERPINA9Q86WD7 417 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLHL7Q8IXQ5 586 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GPR156Q8NFN8 814 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GRK7Q8WTQ7 553 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 STYXQ8WUJ0 223 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 NAT6Q93015 286 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 UBE2FQ969M7 185 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SGF29Q96ES7 293 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 DCUN1D1Q96GG9 259 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 VPS35Q96QK1 796 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 RMI1Q9H9A7 625 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CASS4Q9NQ75 786 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 KLC4Q9NSK0 619 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 TBC1D29Q9UFV1 150 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 APPL1Q9UKG1 709 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 WASF3Q9UPY6 502 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 RNF215Q9Y6U7 377 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 MGAQ8IWI9 3026 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 SDK2Q58EX2 2172 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 TRABD2BA6NFA1 517 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 MROH6A6NGR9 719 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GPR89AB7ZAQ6 455 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CHUKO15111 745 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 KMOO15229 486 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 PPM1DO15297 605 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 AVILO75366 819 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CSO75390 466 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 MT-CO3P00414 261 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GOT2P00505 430 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GP1BAP07359 652 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 C1QTNF9P0C862 333 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 GPR89BP0CG08 455 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 RALBP11234 206 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 VCLP18206 1134 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 CD53P19397 219 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 TPSB2P20231 275 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 ADRA1DP25100 572 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 MGAT1P26572 445 aa5.04□□□□□ -1.6
PDE4DIP-240ENST00000613995 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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