RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GVC2	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A6NLC8	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A6NNC1	897 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ADAM12	O43184	909 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PAEP	P09466	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CHRNB1	P11230	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	VDR	P11473	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GJC1	P36383	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEA1	P43355	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LHX1	P48742	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	VAMP2	P63027	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CDR2	Q01850	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CD180	Q99467	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DESI2	Q9BSY9	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JK05	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	OVOL3	O00110	214 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	TULP2	O00295	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934		O00370	1275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CLDN5	O00501	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PER2	O15055	1255 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	BEST1	O76090	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LCA5L	O95447	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	VNN2	O95498	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DDAH2	O95865	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	LCK	P06239	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CA3	P07451	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	ODC1	P11926	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	GZMA	P12544	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC130	P13994	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	PRF1	P14222	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB1	P25685	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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