RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ARL4D	P49703	201 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	STARD8	Q92502	1023 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TCF12	Q99081	682 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LHX9	Q9NQ69	397 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CDYL	Q9Y232	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ASF1A	Q9Y294	204 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	C2orf74	A8MZ97	194 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	BTN3A1	O00481	513 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CES2	O00748	559 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KDM1A	O60341	852 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TPBGL	P0DKB5	382 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MLN	P12872	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CDH3	P22223	829 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	F8A1	P23610	371 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ARNT	P27540	789 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	AOAH	P28039	575 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CCR10	P46092	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CDC20	Q12834	499 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MCU	Q8NE86	351 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ICK	Q9UPZ9	632 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KPNA5	O15131	536 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN12	O43309	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MAP3K7	O43318	606 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	APOA4	P06727	396 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FAM87A	P0C7U9	286 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PLA2G2A	P14555	144 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TCN2	P20062	427 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NMBR	P28336	390 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	DLST	P36957	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CRADD	P78560	199 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	GPS1	Q13098	491 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PRKG2	Q13237	762 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KYNU	Q16719	465 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SYTL3	Q4VX76	610 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TTC27	Q6P3X3	843 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SPESP1	Q6UW49	350 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	OR2A14	Q96R47	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	MENT	Q9BUN1	341 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PIPSL	A2A3N6	862 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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