RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717		K7ERQ8	282 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AP3B1	O00203	1094 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SPAG6	O75602	509 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GYPE	P15421	78 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-DPA1	P20036	260 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DRD1	P21728	446 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ACTN2	P35609	894 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ELK3	P41970	407 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CD86	P42081	329 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ALDH9A1	P49189	494 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MEOX1	P50221	254 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ITGA1	P56199	1179 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CTXN1	P60606	82 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MAX	P61244	160 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AP1S1	P61966	158 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH17	Q12864	832 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAF2	Q12933	501 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MTAP	Q13126	283 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CRYM	Q14894	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	KYNU	Q16719	465 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	EMC10	Q5UCC4	262 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LINGO4	Q6UY18	593 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00523	Q86TU6	105 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PDIK1L	Q8N165	341 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MUL1	Q969V5	352 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TLCD1	Q96CP7	247 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SEMA3C	Q99985	751 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NAT9	Q9BTE0	207 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	IL22	Q9GZX6	179 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	EBF3	Q9H4W6	596 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SYBU	Q9NX95	663 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS28	Q9UK41	221 aa		5.67	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717		E7EVH7	732 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717		F8W8V4	182 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717		H3BQF6	201 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717		H7C0S8	307 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LDB2	O43679	373 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ATG13	O75143	517 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	USP12	O75317	370 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	USP1	O94782	785 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PGLS	O95336	258 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MED26	O95402	600 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NDST3	O95803	873 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AGT	P01019	485 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AMY1A	P04745	511 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FGF1	P05230	155 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CTSL	P07711	333 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PDHA1	P08559	390 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINF2	P08697	491 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PGAM1	P18669	254 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MGAT1	P26572	445 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VIPR1	P32241	457 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CASP2	P42575	452 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CXCL12	P48061	93 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PIK3CG	P48736	1102 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CD97	P48960	835 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NPY2R	P49146	381 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SOX8	P57073	446 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MXRA7	P84157	204 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ECT2L	Q008S8	904 aa		5.66	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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