RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PCSK5Q92824 1860 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ARGFXA6NJG6 315 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 MEN1O00255 615 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 HCRTR1O43613 425 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 TPBGLP0DKB5 382 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 RORAP35398 523 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 MLLT10P55197 1068 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 KLRB1Q12918 225 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 DSELQ8IZU8 1212 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CARFQ8N187 725 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ELMO1Q92556 727 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 GPR87Q9BY21 358 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PCMTD2Q9NV79 361 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 IMPACTQ9P2X3 320 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 LIASO43766 372 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 IFNB1P01574 187 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CTSBP07858 339 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PTGIRP43119 386 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CD151P48509 253 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 RPA4Q13156 261 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SNX1Q13596 522 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SYVN1Q86TM6 617 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 OR8K5Q8NH50 307 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CPT1BQ92523 772 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FANCEQ9HB96 536 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FAM60AQ9NP50 221 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 LATS2Q9NRM7 1088 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 C2orf74A8MZ97 194 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 MATN2O00339 956 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 AP2A2O94973 939 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CAPN1P07384 714 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CYP2A7P20853 494 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PSMA3P25788 255 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ACADLP28330 430 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 NSG1P42857 185 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SEMA3AQ14563 771 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZIC1Q15915 447 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SPESP1Q6UW49 350 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 TEX19Q8NA77 164 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 HDAC10Q969S8 669 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ASF1AQ9Y294 204 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PSMD3O43242 534 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 RECKO95980 971 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 UGT2B7P16662 529 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CCL11P51671 97 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 GSDMDP57764 484 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CDH17Q12864 832 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ITIH4Q14624 930 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PACS1Q6VY07 963 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF534Q76KX8 674 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 LRFN5Q96NI6 719 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 OR2A14Q96R47 310 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 ING2Q9H160 280 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SNX7Q9UNH6 387 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 SLC5A10A0PJK1 596 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRK-208ENST00000392449 IQCF5A8MTL0 148 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms