RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 RETREG3Q86VR2 466 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-201ENST00000331789 TCAIMQ8N3R3 496 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-201ENST00000331789 PYCR2Q96C36 320 aa17.48■□□□□ 0.39
ACTB-201ENST00000331789 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
ACTB-201ENST00000331789 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
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ACTB-201ENST00000331789 ADA2Q9NZK5 511 aa17.47■□□□□ 0.39
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ACTB-201ENST00000331789 BCL7AQ4VC05 210 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A7Q8TE54 656 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 FBXL8Q96CD0 374 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 ACTR8Q9H981 624 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 TRIM39Q9HCM9 518 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 STOML1Q9UBI4 398 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 CROTQ9UKG9 612 aa17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A14Q9Y267 594 aa17.45■□□□□ 0.38
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