RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 KNL1Q8NG31 2342 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PRR19A6NJB7 356 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PDZK1P1A8MUH7 402 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 COPEO14579 308 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 FFAR2O15552 330 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 FLRT2O43155 660 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 AQP9O43315 295 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SH3BP5O60239 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PCDHGA12O60330 932 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SNX2O60749 519 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 GLRA3O75311 464 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 KLHL2O95198 593 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 TSPAN12O95859 305 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 GSTA1P08263 222 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 GIMD1P0DJR0 217 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 MPC1LP0DKB6 136 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 COL6A2P12110 1019 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PDHA2P29803 388 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 HALP42357 657 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 MAPK9P45984 424 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 CLCNKAP51800 687 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 ATP6V0D1P61421 351 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SLC18A2Q05940 514 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 XKR5Q6UX68 686 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PIP4P1Q86T03 277 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 CLEC14AQ86T13 490 aa6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 NRROSQ86YC3 692 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 VRK3Q8IV63 474 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 NAXDQ8IW45 347 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SLC25A45Q8N413 288 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 EID2Q8N6I1 236 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 DEFB124Q8NES8 71 aa6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 TLCD1Q96CP7 247 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 APOPT1Q96IL0 206 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 FOPNLQ96NB1 174 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 RTKNQ9BST9 563 aa6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 MED4Q9NPJ6 270 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 MKS1Q9NXB0 559 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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PRPF8-210ENST00000574217 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 CFAP54Q96N23 3096 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 NEMP2A6NFY4 417 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 LMO7DNF2Z398 122 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 BTN3A1O00481 513 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 TRIM38O00635 465 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 GIPC1O14908 333 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 ZBTB14O43829 449 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 CBFA2T3O75081 653 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SPAG7O75391 227 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF8-210ENST00000574217 CATP04040 527 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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