RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552268.5

APAF1-211, Transcript of apoptotic peptidase activating factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APAF1, Length 1,143 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1-211ENST00000552268 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 USP34Q70CQ2 3546 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.5□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DMDP11532 3685 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 A0A1B0GVT2 93 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CCDC78A2IDD5 438 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 OR51F1A6NGY5 319 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 A6NNZ2 444 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TOR1BO14657 336 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SGTAO43765 313 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PPM1BO75688 479 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 USP1O94782 785 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 LMNAP02545 664 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SLC4A1P02730 911 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PCCBP05166 539 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ZNF806P0C7X5 589 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 THEGLP0DJG4 465 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MYBL2P10244 700 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TSHRP16473 764 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FOXN2P32314 431 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SPAM1P38567 509 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MPLP40238 635 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ELK3P41970 407 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 POLD2P49005 469 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ARL4CP56559 192 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 KIAA1024LP59773 190 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GPX6P59796 221 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CDK3Q00526 305 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 B4GALNT1Q00973 533 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PDE1BQ01064 536 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CAV1Q03135 178 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CALCOCO2Q13137 446 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 NFATC2Q13469 925 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CCDC6Q16204 474 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ALS2CLQ60I27 953 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 STEAP4Q687X5 459 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SNX20Q7Z614 316 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PDIK1LQ8N165 341 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 LILRB2Q8N423 598 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CEP76Q8TAP6 659 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SNX19Q92543 992 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TCEAL3Q969E4 200 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 LRRC39Q96DD0 335 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SMOXQ9NWM0 555 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 APPL1Q9UKG1 709 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PKP3Q9Y446 797 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 NUMA1Q14980 2115 aa6.49□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 NDC80O14777 642 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 CHUKO15111 745 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 INPP4BO15327 924 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DNAJC6O75061 913 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 VAPBO95292 243 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 FAM153BP0C7A2 387 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GIMD1P0DJR0 217 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 PGAM1P18669 254 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GABRB3P28472 473 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 MC4RP32245 332 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 HADHAP40939 763 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 DPP6P42658 865 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 GPR1P46091 355 aa6.48□□□□□ -1.37
APAF1-211ENST00000552268 RABIFP47224 123 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms