RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 MRNIPQ6NTE8 343 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 CEACAM20Q6UY09 585 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 DTX1Q86Y01 620 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 KRT222Q8N1A0 295 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 OR52E1Q8NGJ3 308 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 HGH1Q9BTY7 390 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 P2RY12Q9H244 342 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 SRMSQ9H3Y6 488 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.27■■□□□ 1
PUS1-211ENST00000544662 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 STMND1H3BQB6 276 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PAMP19021 973 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SH3BP2P78314 561 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 FOXM1Q08050 763 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PRKG2Q13237 762 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 LRRC6Q86X45 466 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 OR5AR1Q8NGP9 310 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 UBXN4Q92575 508 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 CD180Q99467 661 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 NRTNQ99748 197 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 MAP3K3Q99759 626 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ASF1AQ9Y294 204 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TLCD2A6NGC4 264 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 AOAHP28039 575 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PAFAH1B1P43034 410 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 IZUMO3Q5VZ72 239 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TMEM135Q86UB9 458 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SLC22A15Q8IZD6 547 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SLC41A2Q96JW4 573 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 RUNDC3BQ96NL0 473 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TCF12Q99081 682 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ZPBPQ9BS86 351 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 CDYLQ9Y232 598 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.25■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 CCDC188H7C350 402 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 GPC4O75487 556 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 APOA4P06727 396 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 OGNP20774 298 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 IVDP26440 423 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 DR1Q01658 176 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PRKAA1Q13131 559 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 NEPROQ6NW34 567 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PCGF5Q86SE9 256 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 VRK3Q8IV63 474 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 LPGAT1Q92604 370 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PANX3Q96QZ0 392 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 OR6C1Q96RD1 312 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 SPRY4Q9C004 299 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 XKR8Q9H6D3 395 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 RNF14Q9UBS8 474 aa21.24■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 BTN3A3O00478 584 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 BTN3A1O00481 513 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 PFDN6O15212 129 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 FMO4P31512 558 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 ATP1A2P50993 1020 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 VAC14Q08AM6 782 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 TMED2Q15363 201 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 MANEAQ5SRI9 462 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 VASH2Q86V25 355 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 HOOK3Q86VS8 718 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.23■□□□□ 0.99
PUS1-211ENST00000544662 KMT5CQ86Y97 462 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms