RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM234BA2RU67 622 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4Q2P0C623 313 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDH1P12830 882 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFI30P13284 250 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHIT1Q13231 466 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAG1Q14118 895 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HERC3Q15034 1050 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CADM2Q8N3J6 435 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPP5Q8N3R9 675 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSER1Q9NX31 292 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR6C75A6NL08 312 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TACR2P21452 398 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTR7P34969 479 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTGS2P35354 604 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDH15P55291 814 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCN1O60741 890 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GIMD1P0DJR0 217 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R39P59534 338 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPB3Q12988 150 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POMZP3Q6PJE2 187 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHST4Q8NCG5 386 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SKA1Q96BD8 255 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYOCQ99972 504 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDLIM1O00151 329 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KERAO60938 352 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1RP00736 705 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEBPGP53567 150 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINGO4Q6UY18 593 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR8D1Q8WZ84 308 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD84Q9UIB8 345 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AQP12BA6NM10 295 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XKRYO14609 159 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRM6O15303 877 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEAD4Q15561 434 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPTX1Q15818 432 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAT16Q8N8M0 369 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C8orf48Q96LL4 319 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A4Q9H015 551 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C1orf109Q9NX04 203 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL20A1Q9P218 1284 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A075B6Q4 140 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GMFGO60234 142 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKD3O94806 890 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CREMQ03060 361 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAPTM5Q13571 262 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADNP2Q6IQ32 1131 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINGO2Q7L985 606 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL1A2P08123 1366 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBX5P45973 191 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAPK12P53778 367 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCDC1P59894 354 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FEM1CQ96JP0 617 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF358Q9NW07 568 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FFAR2O15552 330 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNTTP04053 509 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYP11A1P05108 521 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTR1BP28222 390 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 L1CAMP32004 1257 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARL2P36404 184 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNASE1L1P49184 302 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUBA4AP68366 448 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUSP4Q13115 394 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMK1Q14012 370 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF347Q96SE7 839 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC3Q9BY71 257 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OXSMQ9NWU1 459 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.89■□□□□ 0.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGSF9Q9P2J2 1179 aa16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms