RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 DPY30Q9C005 99 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.08■□□□□ 0.81
IMP4-208ENST00000460766 SEC22BO75396 215 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 EFEMP2O95967 443 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ARSFP54793 590 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SEMG2Q02383 582 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF7Q14155 803 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CRY1Q16526 586 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 FBXO30Q8TB52 745 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CPQQ9Y646 472 aa20.08■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SLC28A1O00337 649 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GGT5P36269 586 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MTHFRP42898 656 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PMS2P3Q13401 168 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 USP51Q70EK9 711 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GTF2H4Q92759 462 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 K7EPI3 171 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 UPK1AO00322 258 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GNPDA1P46926 289 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CTBSQ01459 385 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TPGS2Q68CL5 300 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 STK32CQ86UX6 486 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MUS81Q96NY9 551 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.07■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PITPNM1O00562 1244 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GREM1O60565 184 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TCF3P15923 654 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 EPB42P16452 691 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PPP3CCP48454 512 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ALDH3A2P51648 485 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CYP4F3Q08477 520 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 GPR180Q86V85 440 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 AADATQ8N5Z0 425 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LEMD2Q8NC56 503 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ABCG8Q9H221 673 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LIMD1Q9UGP4 676 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LATS1O95835 1130 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PGRP06401 933 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SPAM1P38567 509 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MACC1Q6ZN28 852 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 KCTD8Q6ZWB6 473 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ITIH5Q86UX2 942 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.06■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 H0YAE9 185 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 DAG1Q14118 895 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 RAB39AQ14964 217 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CDKN3Q16667 212 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 CCDC115Q96NT0 180 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 KLHL33A6NCF5 533 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 MANBAO00462 879 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 BNIP3LO60238 219 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 SOD2P04179 222 aa20.05■□□□□ 0.8
IMP4-208ENST00000460766 IL6P05231 212 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms