RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEA6P43360 314 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 GPS1Q13098 491 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 BRD3Q15059 726 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC6Q6NXE6 501 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 NAPRTQ6XQN6 538 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 KMT5CQ86Y97 462 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 COG1Q8WTW3 980 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 PPM1MQ96MI6 270 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 SRMSQ9H3Y6 488 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 CATSPERZQ9NTU4 200 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 SYBUQ9NX95 663 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 SLC5A10A0PJK1 596 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 FGF5P12034 268 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 ACADLP28330 430 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 NMBRP28336 390 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 TERF1P54274 439 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 CYP4F2P78329 520 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 CYP1B1Q16678 543 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 OR52E1Q8NGJ3 308 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 HGH1Q9BTY7 390 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 KIFC1Q9BW19 673 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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HOXB3-202ENST00000460160 POMT2Q9UKY4 750 aa23.02■■□□□ 1.28
HOXB3-202ENST00000460160 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 KRT14P02533 472 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 EBLN1P0CF75 366 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD18Q0P651 414 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PRKG2Q13237 762 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TUBB3Q13509 450 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 LY6DQ14210 128 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 MAP7Q14244 749 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 UNC5BQ8IZJ1 945 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 D2HGDHQ8N465 521 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 BSNQ9UPA5 3926 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ITGB2P05107 769 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ARNTP27540 789 aa23■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 HSD11B2P80365 405 aa23■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R3BQ86XI6 285 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 RASGRP3Q8IV61 690 aa23■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 ESX1Q8N693 406 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 OR5AR1Q8NGP9 310 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ANAPC5Q9UJX4 755 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 NEU2Q9Y3R4 380 aa23■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 MATN2O00339 956 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 BTN3A3O00478 584 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 BTN3A1O00481 513 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 AVILO75366 819 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA0754O94854 1291 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TIAF1O95411 115 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ITGB6P18564 788 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 TTPAP49638 278 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CES3Q6UWW8 571 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 EXTL1Q92935 676 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD3Q96ES6 412 aa22.99■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 PDE7BQ9NP56 450 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 SOX13Q9UN79 622 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ASF1AQ9Y294 204 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 F8W8V4 182 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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HOXB3-202ENST00000460160 TMEM63AO94886 807 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CCR7P32248 378 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ARL4DP49703 201 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 ACY1Q03154 408 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 LINC00303Q3SY05 128 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HOXB3-202ENST00000460160 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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