RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362449.1

RN7SKP25-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP25, Length 308 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP25-201ENST00000362449 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 A6NL46 340 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 GRID2O43424 1007 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 NUAK1O60285 661 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 DPM1O60762 260 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 RASSF9O75901 435 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CLDN7O95471 211 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PRLP01236 227 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 MT-ND3P03897 115 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 EBLN1P0CF75 366 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 BRAFP15056 766 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 NFKB1P19838 968 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PSMB4P28070 264 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CAPZBP47756 277 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ITGA1P56199 1179 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 GPS2Q13227 327 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 DUPD1Q68J44 220 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 USP45Q70EL2 814 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SYVN1Q86TM6 617 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 BBS5Q8N3I7 341 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 TEX26Q8N6G2 289 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 IFT81Q8WYA0 676 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 INPP5DQ92835 1189 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 MARVELD3Q96A59 401 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 LRRC45Q96CN5 670 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 GPR87Q9BY21 358 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 GLOD4Q9HC38 313 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 KLC4Q9NSK0 619 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 UBP1Q9NZI7 540 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 AKAP9Q99996 3911 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 OR5K4A6NMS3 321 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 E7EVH7 732 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLC2A4P14672 509 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ZNF30P17039 623 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 AMD1P17707 334 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 IVDP26440 423 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 LMAN1P49257 510 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CLCNKAP51800 687 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ITGA8P53708 1063 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 DSC2Q02487 901 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CALCOCO2Q13137 446 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 TUBB3Q13509 450 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 RAPSNQ13702 412 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 GPR18Q14330 331 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PRPSAP1Q14558 356 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PARP6Q2NL67 630 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 IRGCQ6NXR0 463 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 C4orf22Q6V702 233 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 IFT20Q8IY31 132 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 EID2BQ96D98 161 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SNF8Q96H20 258 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 GBA3Q9H227 469 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CHST8Q9H2A9 424 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 RMI1Q9H9A7 625 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 FAM114A2Q9NRY5 505 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 RARRES3Q9UL19 164 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.28□□□□□ -1.08
RN7SKP25-201ENST00000362449 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RN7SKP25-201ENST00000362449 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.27□□□□□ -1.09
RN7SKP25-201ENST00000362449 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.27□□□□□ -1.09
RN7SKP25-201ENST00000362449 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.27□□□□□ -1.09
RN7SKP25-201ENST00000362449 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RN7SKP25-201ENST00000362449 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.27□□□□□ -1.09
RN7SKP25-201ENST00000362449 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms