RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635738.1

CACNB4-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, humanhuman

TSL 5

Gene CACNB4, Length 7,854 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB4-212ENST00000635738 CYP4B1P13584 511 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 MPIP34949 423 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 HTR7P34969 479 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SLC16A2P36021 539 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 FMO5P49326 533 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RRADP55042 308 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ZNF45Q02386 682 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 BNIP3Q12983 259 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SP140Q13342 867 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 KCNJ8Q15842 424 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PTGISQ16647 500 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 AGAP6Q5VW22 663 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 MUC15Q8N387 334 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 OR5L2Q8NGL0 311 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 BAP1Q92560 729 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 AGAP4Q96P64 663 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SLC19A3Q9BZV2 496 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SNX24Q9Y343 169 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 USP31Q70CQ4 1352 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 A0A087X0B3 334 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 H3BRB1 525 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PLOD3O60568 738 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 FTCDO95954 541 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 C1RP00736 705 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CYP11A1P05108 521 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ALPIP09923 528 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 NT5EP21589 574 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 NEDD4P46934 1319 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 AKR1D1P51857 326 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SLC13A2Q13183 592 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PDK3Q15120 406 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CRY2Q49AN0 593 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ARAP3Q8WWN8 1544 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 NRCAMQ92823 1304 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TP53INP1Q96A56 240 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RNF145Q96MT1 663 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ASB8Q9H765 288 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 WDR26Q9H7D7 661 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 MLXQ9UH92 298 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 FBXW2Q9UKT8 454 aa4.05□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PALLDQ8WX93 1383 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 JCADQ9P266 1359 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 A0A0G2JPF8 293 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 H0Y858 1186 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 J3QR89 54 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 LAMTOR5O43504 91 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 DFNA5O60443 496 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 YES1P07947 543 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 GNB3P16520 340 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 IL4RP24394 825 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ACSL1P33121 698 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RAB28P51157 221 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ATP6V0D1P61421 351 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TUBA4AP68366 448 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 HMGCS1Q01581 520 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 BNIP2Q12982 314 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CRMP1Q14194 572 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ZNF767PQ75MW2 155 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 ZNF611Q8N823 705 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TSPYL6Q8N831 410 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PIGXQ8TBF5 258 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 NELL2Q99435 816 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CDC6Q99741 560 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.04□□□□□ -1.76
CACNB4-212ENST00000635738 PNPLA6Q8IY17 1366 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms