RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.11□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 CFAP99D6REC4 459 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PSMD3O43242 534 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PSMA3P25788 255 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 NDUFS1P28331 727 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 CSRP3P50461 194 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 HSD11B2P80365 405 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ERV3-1Q14264 604 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 STYXQ8WUJ0 223 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 DESI2Q9BSY9 194 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 CLMPQ9H6B4 373 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 COG4Q9H9E3 785 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 FGF21Q9NSA1 209 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 KCND3Q9UK17 655 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 KATNA1O75449 491 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 AP2A1O95782 977 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 RECKO95980 971 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 NTRK1P04629 796 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PDHA2P29803 388 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ARL4DP49703 201 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 DNASE1L3Q13609 305 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 KRT33BQ14525 404 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 POU6F1Q14863 301 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 CARFQ8N187 725 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 CT55Q8WUE5 264 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PPM1MQ96MI6 270 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 KCND1Q9NSA2 647 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.09□□□□□ -0.15
CS-229ENST00000551936 MROH6A6NGR9 719 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 CREG1O75629 220 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 CDC25BP30305 580 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 CD151P48509 253 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TUBB4BP68371 445 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 CACNG1Q06432 222 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TUBB2AQ13885 445 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 GPR19Q15760 415 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 DBN1Q16643 649 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 P3H1Q32P28 736 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 PHC3Q8NDX5 983 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 RUFY1Q96T51 708 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 NRTNQ99748 197 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 BTRCQ9Y297 605 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TENM4Q6N022 2769 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 C21orf140B9A014 251 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 BTN3A3O00478 584 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 AP2A2O94973 939 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 PRKAA1Q13131 559 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 RPA4Q13156 261 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 SEPT6Q14141 434 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TMEM135Q86UB9 458 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 SPC24Q8NBT2 197 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 LCN9Q8WX39 176 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-229ENST00000551936 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms