RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497315.5

PSMD6-211, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMD6, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-211	ENST00000497315	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315		A0A087WYN8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MSH3	P20585	1137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	EPHA2	P29317	976 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	THOP1	P52888	689 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CDK3	Q00526	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MFAP5	Q13361	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	OLFM1	Q99784	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	P4HA2	O15460	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PRSS1	P07477	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	GNAZ	P19086	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	NME8	Q8N427	588 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315		A0A0B4J293	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ADRB2	P07550	413 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	KRT20	P35900	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	NUCB1	Q02818	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	GRID2	O43424	1007 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CIDEA	O60543	219 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TSPAN1	O60635	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	MED24	O75448	989 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PAX1	P15863	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	DCT	P40126	519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	NR2C2	P49116	596 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	UBXN2A	P68543	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	IL11RA	Q14626	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	NR1D2	Q14995	579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMD6-211	ENST00000497315	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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