RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 IQCF5A8MTL0 148 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 F8W8V4 182 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 NDUFS3O75489 264 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ITGB6P18564 788 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PAMP19021 973 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.864e-30■■□□□ 12.4
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A2P31639 672 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CCR7P32248 378 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MAPK10P53779 464 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 BRD3Q15059 726 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 USP7Q93009 1102 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 C9orf72Q96LT7 481 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 DCBLD2Q96PD2 775 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 USP1O94782 785 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ACADLP28330 430 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 NDUFS1P28331 727 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PLCL1Q15111 1095 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MSS51Q4VC12 460 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 NEPROQ6NW34 567 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PDZD3Q86UT5 571 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KRT222Q8N1A0 295 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PHC3Q8NDX5 983 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 LPGAT1Q92604 370 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 BIRC8Q96P09 236 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TGM7Q96PF1 710 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 C9orf172C9J069 976 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 GPC4O75487 556 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KRT33BQ14525 404 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MORF4L2Q15014 288 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CENPUQ71F23 418 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 LRRC6Q86X45 466 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TCF12Q99081 682 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CDYLQ9Y232 598 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 OR5K3A6NET4 321 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB7A8K855 629 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 B4E171 279 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TP73O15350 636 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF10O60809 474 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 BANF1O75531 89 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KRT37O76014 449 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ITPKBP27987 946 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 AOAHP28039 575 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TSPAN7P41732 249 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PPP1CAP62136 330 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SYTL3Q4VX76 610 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 IRGCQ6NXR0 463 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KLHL35Q6PF15 583 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CILP2Q8IUL8 1156 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 BMPERQ8N8U9 685 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PMEPA1Q969W9 287 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PWWP2AQ96N64 755 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TSSK1BQ9BXA7 367 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.4■□□□□ 0.86
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