RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	THAP9	Q9H5L6	903 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBBP4-208	ENST00000463378	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	hDV102S1	A0JD36	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378		I6L893	689 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PTGES	O14684	152 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	CAMTA2	O94983	1202 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	SOX30	O94993	753 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	EPN2	O95208	641 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	MYL6B	P14649	208 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	WNT5A	P41221	380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	NT5C2	P49902	561 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	BPIFB3	P59826	476 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	DPT	Q07507	201 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	WASHC5	Q12768	1159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	FHL2	Q14192	279 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	TCTE1	Q5JU00	501 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PRR27	Q6MZM9	219 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	NSMAF	Q92636	917 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	DPF1	Q92782	380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	NLRP4	Q96MN2	994 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	RHCG	Q9UBD6	479 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	FZD10	Q9ULW2	581 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC7	Q96M83	1385 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PPFIA2	O75334	1257 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PLA2G4B	P0C869	781 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	P4HA1	P13674	534 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP11B2	P19099	503 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	ITIH1	P19827	911 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNJ4	P48050	445 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	MXI1	P50539	228 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PDE1B	Q01064	536 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378		Q4G0T1	1027 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PARP10	Q53GL7	1025 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM219A	Q8IW50	185 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	CNIH4	Q9P003	139 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PADI3	Q9ULW8	664 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49	9e-9	■□□□□ 8.4
RBBP4-208	ENST00000463378	TAF1	P21675	1872 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	NCOA2	Q15596	1464 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPRC	P08575	1304 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	NAIP	Q13075	1403 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2M5	A3KFT3	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	C5orf52	A6NGY3	159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	C19orf81	C9J6K1	198 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	DVL1	O14640	695 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	AP5Z1	O43299	807 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	CRCP	O75575	148 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	NUDT3	O95989	172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBBP4-208	ENST00000463378	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49

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