RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NECTIN3Q9NQS3 549 aa16.58■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.58■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.58■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.58■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 C9JVG2 144 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 UGT2B11O75310 529 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ITGB1P05556 798 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 G6PDP11413 515 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NFKBIAP25963 317 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SLC11A2P49281 568 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 AGTR2P50052 363 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CLCN7P51798 805 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PLA2G16P53816 162 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 BNIP3Q12983 259 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TRAF3Q13114 568 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NR1D2Q14995 579 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PLCL1Q15111 1095 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PYCR3Q53H96 274 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF691Q5VV52 312 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NADSYN1Q6IA69 706 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MICU2Q8IYU8 434 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 HASPINQ8TF76 798 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC138Q96M89 665 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NSMCE3Q96MG7 304 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MBOAT4Q96T53 435 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PTPN18Q99952 460 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 LHPPQ9H008 270 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CWH43Q9H720 699 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CCL27Q9Y4X3 112 aa16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEB3O15480 346 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CST1P01037 141 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PRLP01236 227 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM32Q13049 653 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CBX3Q13185 183 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRCAPQ14761 206 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MAPKAPK3Q16644 382 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DDR2Q16832 855 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ITIH5Q86UX2 942 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 LGI2Q8N0V4 545 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PGBD3Q8N328 593 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MDGA1Q8NFP4 955 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GTF2H4Q92759 462 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 FKBP10Q96AY3 582 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PLD4Q96BZ4 506 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CAPNS2Q96L46 248 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PPM1MQ96MI6 270 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ACOX2Q99424 681 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ACTR8Q9H981 624 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 OARD1Q9Y530 152 aa16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 A0A096LPI6 279 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CXCR6O00574 342 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 GABARAPO95166 117 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 JUNDP17535 347 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CD247P20963 164 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CDH3P22223 829 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ELK4P28324 431 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 THPOP40225 353 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MAGEA2P43356 314 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 KEAP1Q14145 624 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CALHM3Q86XJ0 350 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MIB1Q86YT6 1006 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 PLPP6Q8IY26 295 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NODALQ96S42 347 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 NTMT1Q9BV86 223 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 MROQ9BYG7 248 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 CLMPQ9H6B4 373 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 RDH14Q9HBH5 336 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ATAD3AQ9NVI7 634 aa16.55■□□□□ 0.24
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms