RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 CACNG4Q9UBN1 327 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ARL5AQ9Y689 179 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FZD9O00144 591 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MPZL2O60487 215 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CBFA2T3O75081 653 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DQB2P05538 268 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 WDR4P57081 412 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F8P98187 520 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CCL14Q16627 93 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MINDY4Q4G0A6 757 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 C6orf52Q5T4I8 152 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 OR52J3Q8NH60 311 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SH3RF2Q8TEC5 729 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RIPOR3Q96MK2 946 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CHID1Q9BWS9 393 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 EBPLQ9BY08 206 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 BCL2L14Q9BZR8 327 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SUV39H2Q9H5I1 410 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MAP10Q9P2G4 905 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 IKZF2Q9UKS7 526 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 XKRYO14609 159 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CSKP41240 450 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CRHR2Q13324 411 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 IMPDH1P20839 514 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FOXN2P32314 431 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-8P63133 956 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC10A7Q0GE19 358 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GIPC3Q8TF64 312 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SCLYQ96I15 445 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 BCO2Q9BYV7 579 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FBXW2Q9UKT8 454 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 YIPF1Q9Y548 306 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SHPRHQ149N8 1683 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 UNCXA6NJT0 531 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LYNP07948 512 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 KCNE1P15382 129 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 PAQR3Q6TCH7 311 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 AMZ2Q86W34 360 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 MATN4O95460 622 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 TGFBR2P37173 567 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 HERVK_113P63132 956 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RALGPS1Q5JS13 557 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35F5Q8WV83 523 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 NSMCE3Q96MG7 304 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-6Q9BXR3 956 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GDAP2Q9NXN4 497 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 NFAT5O94916 1531 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 C9IYK1 514 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CXCR6O00574 342 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ALAS2P22557 587 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GJA9P57773 515 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 LIN52Q52LA3 116 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FAM234BA2RU67 622 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 HSPB3Q12988 150 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 RAPSNQ13702 412 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 IFI44LQ53G44 452 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 FAM91A1Q658Y4 838 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 CADM2Q8N3J6 435 aa19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CCSAP-203ENST00000366687 UGT1A9O60656 530 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 MNDAP41218 407 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 CDH24Q86UP0 819 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 UGT1A7Q9HAW7 530 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 UGT1A10Q9HAW8 530 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 UGT1A8Q9HAW9 530 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ITM2CQ9NQX7 267 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 GKN1Q9NS71 199 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 OXSMQ9NWU1 459 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 OSER1Q9NX31 292 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 RIIAD1A6NNX1 92 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 STX16O14662 325 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 WNT9AO14904 365 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEB3O15480 346 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 TEX28O15482 410 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 HCN1O60741 890 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 CDH12P55289 794 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 IFNL1Q8IU54 200 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 LRTOMTQ8WZ04 291 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 PDCD10Q9BUL8 212 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 POLE3Q9NRF9 147 aa19.95■□□□□ 0.78
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PRU2 124 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms