RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 COMMD3Q9UBI1 195 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 MEIOCA2RUB1 952 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PRKCAP17252 672 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 MATKP42679 507 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 RORCP51449 518 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 BCL2A1Q16548 175 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 DDI2Q5TDH0 399 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 AP3S1Q92572 193 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 QPCTLQ9NXS2 382 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FZD1Q9UP38 647 aa16.38■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ATF6P18850 670 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PPP3CCP48454 512 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 P2RX3P56373 397 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 XKRXQ6PP77 449 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 NRARPQ7Z6K4 114 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 AIFM2Q9BRQ8 373 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 COL20A1Q9P218 1284 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FAM234BA2RU67 622 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CASKO14936 926 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 B4GALT5O43286 388 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ITGALP20701 1170 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 RAPSNQ13702 412 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ADPRMQ3LIE5 342 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 METTL23Q86XA0 190 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 OR52J3Q8NH60 311 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 MUL1Q969V5 352 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 LRCH3Q96II8 777 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 MEAF6Q9HAF1 191 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ARRB2P32121 409 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 GGT5P36269 586 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SELPLGQ14242 412 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FAM151AQ8WW52 585 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 TEX12Q9BXU0 123 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 BTAF1O14981 1849 aa16.37■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 KLK14Q9P0G3 267 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SMIM30A4D0T7 59 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 KPNA6O60684 536 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 C1RP00736 705 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CD1EP15812 388 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 TNNI3P19429 210 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 WNT7BP56706 349 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CDK5R2Q13319 367 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SGCDQ92629 289 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 MLXQ9UH92 298 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ZNF195O14628 629 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 OR4F21O95013 312 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FABP3P05413 133 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PIRTP0C851 137 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ITGB6P18564 788 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 AQP6Q13520 282 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 TREML2Q5T2D2 321 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SPRED1Q7Z699 444 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 CDT1Q9H211 546 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ASB7Q9H672 318 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 POLHQ9Y253 713 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 LRATO95237 230 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 HPRP00739 348 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 SOAT1P35610 550 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 RPA4Q13156 261 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 STK11Q15831 433 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 STRADAQ7RTN6 431 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD46Q86W74 232 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 KCNC2Q96PR1 638 aa16.36■□□□□ 0.21
PACS1-201ENST00000320580 GON7Q9BXV9 100 aa16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms