RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.87■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 RAB33BQ9H082 229 aa20.87■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 COG4Q9H9E3 785 aa20.87■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.87■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TPSB2P20231 275 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CXADRP78310 365 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 MC2RQ01718 297 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TGIF1Q15583 401 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TPSAB1Q15661 275 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF534Q76KX8 674 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 OR4L1Q8NH43 312 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TGM7Q96PF1 710 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 IL22Q9GZX6 179 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 BFARQ9NZS9 450 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ADAMTS20P59510 1910 aa20.86■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 QSOX1O00391 747 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 RAB15P59190 212 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PRAMEP78395 509 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 RPA4Q13156 261 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 GSE1Q14687 1217 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KLHL35Q6PF15 583 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TTC1Q99614 292 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SNX12Q9UMY4 172 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.85■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KIF26BQ2KJY2 2108 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 BPTFQ12830 3046 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CES2O00748 559 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KRT14P02533 472 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 MAGEA6P43360 314 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CD151P48509 253 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CRADDP78560 199 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 GPS1Q13098 491 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PLCL1Q15111 1095 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ANKS6Q68DC2 871 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TREX1Q9NSU2 369 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CHD6Q8TD26 2715 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 STMND1H3BQB6 276 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 NDUFS1P28331 727 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 PDHA2P29803 388 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 VPS41P49754 854 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 VAC14Q08AM6 782 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KCNJ11Q14654 390 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 IRGCQ6NXR0 463 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 KIFC1Q9BW19 673 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.83■□□□□ 0.93
RNPS1-218ENST00000566180 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 USP27XA6NNY8 438 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 K7ENP7 123 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 EFSO43281 561 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 OR1I1O60431 355 aa20.82■□□□□ 0.92
RNPS1-218ENST00000566180 RASSF9O75901 435 aa20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms