RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRM3Q14832 879 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYTH1Q15438 398 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 DLG2Q15700 870 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 LIPMQ5VYY2 423 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARMC3Q5W041 872 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PKN3Q6P5Z2 889 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C16orf89Q6UX73 402 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RAPH1Q70E73 1250 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHDDSQ86SQ9 333 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 KBTBD2Q8IY47 623 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF781Q8N8C0 355 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 IPMKQ8NFU5 416 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 STYXQ8WUJ0 223 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RMDN1Q96DB5 314 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MFSD3Q96ES6 412 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCYL1Q96KG9 808 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C20orf173Q96LM9 149 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSKH2Q96QS6 385 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGAP2Q99490 1192 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTC1Q99614 292 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GPR22Q99680 433 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SEMA3CQ99985 751 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ECSITQ9BQ95 431 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 APOL2Q9BQE5 337 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RTKNQ9BST9 563 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MCMBPQ9BTE3 642 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 FICDQ9BVA6 458 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 DRC3Q9H069 523 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHOJQ9H4E5 214 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 COG4Q9H9E3 785 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 GTSE1Q9NYZ3 720 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBP1Q9NZI7 540 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 EBF1Q9UH73 591 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SUN2Q9UH99 717 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 VPS51Q9UID3 782 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBXO10Q9UK96 956 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MUC6Q6W4X9 2439 aa5.53□□□□□ -1.52
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYO10Q9HD67 2058 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A087X1B8 175 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQ67 120 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 NPC1O15118 1278 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 INSIG1O15503 277 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCXO43602 365 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 BUD23O43709 281 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZBTB14O43829 449 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZMPSTE24O75844 475 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PDE5AO76074 875 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMCC1O94876 653 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 KAT7O95251 611 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIGNO95427 931 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 MT-CO1P00395 513 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PGRP06401 933 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZGLP1P0C6A0 271 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CISD3P0C7P0 127 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRFP11831 508 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 GLULP15104 373 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAMP19021 973 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 FCARP24071 287 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 PIK3R1P27986 724 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 SERPINA4P29622 427 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 TNFRSF4P43489 277 aa5.52□□□□□ -1.53
ARHGEF3-215ENST00000498517 CSNK1DP48730 415 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms