RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.64■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RAD18Q9NS91 495 aa22.64■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RARRES3Q9UL19 164 aa22.64■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.64■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 VEGFDO43915 354 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RNF224P0DH78 156 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 PTPN4P29074 926 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CD86P42081 329 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TUBB3Q13509 450 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 NADK2Q4G0N4 442 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CPZQ66K79 652 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 AADACL2Q6P093 401 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SYVN1Q86TM6 617 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 UBXN4Q92575 508 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RUFY1Q96T51 708 aa22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CEP104O60308 925 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 IDSP22304 550 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 AP1B1Q10567 949 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ALS2CLQ60I27 953 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ACTRT1Q8TDG2 376 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TRIB3Q96RU7 358 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RNF14Q9UBS8 474 aa22.62■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 FGGP02679 453 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RBP3P10745 1247 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 FOLR1P15328 257 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1CAP62136 330 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RPS18P62269 152 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 IL10RAQ13651 578 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 GALNT3Q14435 633 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 LLGL1Q15334 1064 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SLC14A2Q15849 920 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa22.61■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 DDAH2O95865 285 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 RPS15P62841 145 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ACY1Q03154 408 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CCNG2Q16589 344 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TEX44Q53QW1 395 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 KMT5CQ86Y97 462 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CNTD1Q8N815 330 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ING2Q9H160 280 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ACSS2Q9NR19 701 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 SAR1BQ9Y6B6 198 aa22.6■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ENO4A6NNW6 628 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 H7C0C1 242 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 MTX2O75431 263 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CEACAM4O75871 244 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CDK14O94921 469 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 JCHAINP01591 159 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ATP5OP48047 213 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CHAF1BQ13112 559 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 KCNAB1Q14722 419 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CHRNA6Q15825 494 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 VPS35Q96QK1 796 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 FGF21Q9NSA1 209 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF711Q9Y462 761 aa22.59■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 ARGFXA6NJG6 315 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 EBLN1P0CF75 366 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 VCLP18206 1134 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CXCR5P32302 372 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 CCL11P51671 97 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 KLHL35Q6PF15 583 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TEKT5Q96M29 485 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.58■■□□□ 1.21
SIMC1-208ENST00000495423 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms