RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DEFA1P59665 94 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DEFA3P59666 94 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CTF1Q16619 201 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 AHSA2Q719I0 299 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FNDC5Q8NAU1 212 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS12Q96DT0 336 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RHNO1Q9BSD3 238 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC1A7O00341 560 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A1O15245 554 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CAPN1P07384 714 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PIRTP0C851 137 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CASP3P42574 277 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PPP5CP53041 499 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR2B6P58173 313 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SH3BP2P78314 561 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UPP1Q16831 310 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CST9Q5W186 159 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CADM2Q8N3J6 435 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MYOCQ99972 504 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NUAK2Q9H093 628 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SCUBE2Q9NQ36 999 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 CASS4Q9NQ75 786 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SATB2Q9UPW6 733 aa16■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 KRT87PA6NCN2 255 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HHLA1C9JL84 531 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UBXN8O00124 270 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 AKR1A1P14550 325 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NT5MQ9NPB1 228 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FXYD1O00168 92 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD5Q16401 504 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RBBP7Q16576 425 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SULT1C3Q6IMI6 304 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TEX37Q96LM6 180 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 NMUR1Q9HB89 426 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PQH9 124 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR51F1A6NGY5 319 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 H0YAE9 185 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 F9P00740 461 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HSD17B1P14061 328 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 OR1G1P47890 313 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DGKQP52824 942 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DPY19L1Q2PZI1 675 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GIPC2Q8TF65 315 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 COMMD8Q9NX08 183 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.99■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 MEN1O00255 615 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 BCKDKO14874 412 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TSC22D2O75157 780 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GJB3O75712 270 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK2O95069 426 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 KCNC1P48547 511 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA3BQ13214 749 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 TAB1Q15750 504 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 PCID2Q5JVF3 399 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 FAM86B1Q8N7N1 296 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LEMD2Q8NC56 503 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 GABRQQ9UN88 632 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 ITM2BQ9Y287 266 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DQB2P05538 268 aa15.98■□□□□ 0.15
CCSAP-204ENST00000483092 LCKP06239 509 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms