RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 FLNCQ14315 2725 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TLCD2A6NGC4 264 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 NRDCO43847 1150 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 EPOP01588 193 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 BRAFP15056 766 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MSH3P20585 1137 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 F8A1P23610 371 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PGDP52209 483 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 HSD11B2P80365 405 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PRKAA1Q13131 559 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 KRT33BQ14525 404 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SYVN1Q86TM6 617 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TMEM126BQ8IUX1 230 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CARFQ8N187 725 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CT55Q8WUE5 264 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ZFPM2Q8WW38 1151 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ATG4AQ8WYN0 398 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MIB2Q96AX9 1013 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MRGPRX2Q96LB1 330 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 FSD1LQ9BXM9 530 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ACTL8Q9H568 366 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ACSS2Q9NR19 701 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TLK1Q9UKI8 766 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TRHDEQ9UKU6 1024 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PLAAQ9Y263 795 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.74□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 NBASA2RRP1 2371 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TTLL8A6PVC2 850 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CYSRT1A8MQ03 144 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 POP7O75817 140 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 RALBP11234 206 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 HLA-DPA1P20036 260 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PTPN4P29074 926 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CHRNA4P43681 627 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 GDF10P55107 478 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 WNT3AP56704 352 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 DMPKQ09013 629 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 OLIG2Q13516 323 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 GSE1Q14687 1217 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TRIM58Q8NG06 486 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 LRRC45Q96CN5 670 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SLC41A2Q96JW4 573 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ALS2CR12Q96Q35 445 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 FGF21Q9NSA1 209 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SOHLH2Q9NX45 425 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ACSL5Q9ULC5 683 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.73□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 OR2AG2A6NM03 316 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MATN2O00339 956 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 AURKAO14965 403 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SCRG1O75711 98 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 AGTP01019 485 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PTMAP06454 111 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SLC35G4P0C7Q5 338 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PSMB4P28070 264 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CXCR5P32302 372 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 CD97P48960 835 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TUBB4BP68371 445 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MPP3Q13368 585 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SEMA5AQ13591 1074 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TUBB2AQ13885 445 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 RPE65Q16518 533 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 UGT8Q16880 541 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SIRPB2Q5JXA9 342 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SEL1L2Q5TEA6 688 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 ZNF449Q6P9G9 518 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TMEM220Q6QAJ8 160 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 FAM151BQ6UXP7 276 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 FAM71DQ8N9W8 422 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TTC13Q8NBP0 860 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 DDHD1Q8NEL9 900 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 IPMKQ8NFU5 416 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 C1orf54Q8WWF1 131 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 MR1Q95460 341 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 TMEM121Q9BTD3 319 aa13.72□□□□□ -0.21
CITED1-202ENST00000373619 SLC25A23Q9BV35 468 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms