RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajb4Q9D832 337 aa6.52□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TrilQ9DBY4 809 aa6.52□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r238E9Q373 306 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm6502L7N456 481 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hk2O08528 917 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lhx8O35652 367 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TpmtO55060 240 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P04213 122 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100a9P31725 113 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Irs1P35569 1233 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnab2P62482 367 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il11ra2P70225 432 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hdac2P70288 488 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp39Q02525 718 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SPINDOCQ05AH6 381 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd163Q2VLH6 1121 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CenplQ3U3S3 329 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LchnQ3UHG7 455 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ms4a15Q3UPL6 245 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Brsk1Q5RJI5 778 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam71bQ5STT6 665 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FaddQ61160 205 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itih2Q61703 946 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nfe2l1Q61985 741 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VwdeQ6DFV8 926 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q6P2K3 674 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ckmt2Q6P8J7 419 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd300aQ6SJQ0 318 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1046Q7TR79 316 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mib1Q80SY4 1006 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef38Q80VK6 770 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q810N5 247 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ikzf5Q8BU00 419 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem62Q8BXJ9 643 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Asrgl1Q8C0M9 326 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Agr3Q8R3W7 165 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lmcd1Q8VEE1 365 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ca9Q8VHB5 437 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chid1Q922Q9 393 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9CXL3 195 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TrmuQ9DAT5 417 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DguokQ9QX60 277 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldoart2A6ZI47 364 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dthd1E9PZX1 795 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 E2f3O35261 457 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nrp2O35375 931 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn22P29352 802 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grik2P39087 908 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gadd45aP48316 165 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pold1P52431 1105 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccbe1Q3MI99 408 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hhla1Q3TYV2 514 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pfdn4Q3UWL8 134 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Afg1lQ3V384 480 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr6a1Q64249 495 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Txndc15Q6P6J9 344 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpa4Q6P8K8 420 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dsg4Q7TMD7 1041 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chst2Q80WV3 530 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prap1Q80XD8 149 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AW551984Q8BGF0 804 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BHR8 331 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prpf18Q8BM39 342 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem220Q8BP07 167 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr22Q8BZL4 432 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam221bQ8C627 487 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg10Q8R1P4 215 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rprd1aQ8VDS4 312 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adgrf1Q8VEC3 908 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Socs7Q8VHQ2 579 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DcxrQ91X52 244 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Npffr2Q924H0 417 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrps18bQ99N84 254 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VasnQ9CZT5 673 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PgcQ9D7R7 392 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olig2Q9EQW6 323 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Msgn1Q9JK54 188 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B9d1Q9R1S0 204 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt6bQ9Z331 562 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scn8aQ9WTU3 1978 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg2aQ6P4T0 1914 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Baz2bA2AUY4 2123 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znf711A2ANX9 761 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabrr3B2RXA8 464 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam124aD3Z5V4 536 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8369E9PZI3 166 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim15G3UY57 292 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap3O88987 864 aa6.51□□□□□ -1.37
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AldocP05063 363 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.5 ms