Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Dsg4Q7TMD7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Dsg4Q7TMD7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Dsg4Q7TMD7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Dsg4Q7TMD7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Dsg4Q7TMD7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Dsg4Q7TMD7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Dsg4Q7TMD7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Dsg4Q7TMD7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Dsg4Q7TMD7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Dsg4Q7TMD7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Dsg4Q7TMD7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Dsg4Q7TMD7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Dsg4Q7TMD7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Dsg4Q7TMD7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Dsg4Q7TMD7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Dsg4Q7TMD7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Dsg4Q7TMD7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Dsg4Q7TMD7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Dsg4Q7TMD7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dsg4Q7TMD7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Dsg4Q7TMD7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Dsg4Q7TMD7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Dsg4Q7TMD7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Dsg4Q7TMD7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Dsg4Q7TMD7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Dsg4Q7TMD7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dsg4Q7TMD7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Dsg4Q7TMD7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Dsg4Q7TMD7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Dsg4Q7TMD7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Dsg4Q7TMD7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Dsg4Q7TMD7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Dsg4Q7TMD7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Dsg4Q7TMD7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Dsg4Q7TMD7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Dsg4Q7TMD7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Dsg4Q7TMD7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Dsg4Q7TMD7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Dsg4Q7TMD7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Dsg4Q7TMD7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Dsg4Q7TMD7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Dsg4Q7TMD7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Dsg4Q7TMD7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Dsg4Q7TMD7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dsg4Q7TMD7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dsg4Q7TMD7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dsg4Q7TMD7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Dsg4Q7TMD7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dsg4Q7TMD7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dsg4Q7TMD7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dsg4Q7TMD7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dsg4Q7TMD7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dsg4Q7TMD7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dsg4Q7TMD7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Dsg4Q7TMD7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Dsg4Q7TMD7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Dsg4Q7TMD7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Dsg4Q7TMD7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dsg4Q7TMD7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dsg4Q7TMD7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dsg4Q7TMD7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dsg4Q7TMD7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dsg4Q7TMD7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Dsg4Q7TMD7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dsg4Q7TMD7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dsg4Q7TMD7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dsg4Q7TMD7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Dsg4Q7TMD7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dsg4Q7TMD7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dsg4Q7TMD7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dsg4Q7TMD7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dsg4Q7TMD7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dsg4Q7TMD7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Dsg4Q7TMD7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dsg4Q7TMD7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dsg4Q7TMD7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dsg4Q7TMD7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Dsg4Q7TMD7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dsg4Q7TMD7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dsg4Q7TMD7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Dsg4Q7TMD7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Dsg4Q7TMD7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Dsg4Q7TMD7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Dsg4Q7TMD7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dsg4Q7TMD7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dsg4Q7TMD7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Dsg4Q7TMD7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dsg4Q7TMD7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dsg4Q7TMD7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dsg4Q7TMD7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dsg4Q7TMD7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dsg4Q7TMD7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dsg4Q7TMD7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms