Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Trim15G3UY57 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Trim15G3UY57 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Trim15G3UY57 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Trim15G3UY57 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Trim15G3UY57 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Trim15G3UY57 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Trim15G3UY57 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Trim15G3UY57 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Trim15G3UY57 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trim15G3UY57 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Trim15G3UY57 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Trim15G3UY57 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Trim15G3UY57 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Trim15G3UY57 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,53■■■□□ 2
Trim15G3UY57 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Trim15G3UY57 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Trim15G3UY57 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim15G3UY57 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Trim15G3UY57 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Trim15G3UY57 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Trim15G3UY57 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Trim15G3UY57 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Trim15G3UY57 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Trim15G3UY57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Trim15G3UY57 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Trim15G3UY57 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Trim15G3UY57 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,63■■□□□ 1,85
Trim15G3UY57 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Trim15G3UY57 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Trim15G3UY57 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Trim15G3UY57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Trim15G3UY57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Trim15G3UY57 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Trim15G3UY57 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Trim15G3UY57 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Trim15G3UY57 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Trim15G3UY57 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Trim15G3UY57 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Trim15G3UY57 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Trim15G3UY57 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Trim15G3UY57 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Trim15G3UY57 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Trim15G3UY57 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Trim15G3UY57 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Trim15G3UY57 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Trim15G3UY57 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Trim15G3UY57 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Trim15G3UY57 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Trim15G3UY57 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Trim15G3UY57 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Trim15G3UY57 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Trim15G3UY57 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Trim15G3UY57 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Trim15G3UY57 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Trim15G3UY57 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Trim15G3UY57 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Trim15G3UY57 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Trim15G3UY57 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Trim15G3UY57 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Trim15G3UY57 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Trim15G3UY57 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Trim15G3UY57 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim15G3UY57 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Trim15G3UY57 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Trim15G3UY57 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim15G3UY57 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Trim15G3UY57 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trim15G3UY57 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Trim15G3UY57 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Trim15G3UY57 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Trim15G3UY57 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Trim15G3UY57 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Trim15G3UY57 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trim15G3UY57 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Trim15G3UY57 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trim15G3UY57 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trim15G3UY57 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Trim15G3UY57 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Trim15G3UY57 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Trim15G3UY57 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Trim15G3UY57 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Trim15G3UY57 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Trim15G3UY57 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Trim15G3UY57 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Trim15G3UY57 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Trim15G3UY57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Trim15G3UY57 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Trim15G3UY57 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Trim15G3UY57 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Trim15G3UY57 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Trim15G3UY57 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Trim15G3UY57 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
Trim15G3UY57 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Trim15G3UY57 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trim15G3UY57 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Trim15G3UY57 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Trim15G3UY57 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Trim15G3UY57 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Trim15G3UY57 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76,9 ms