RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524226.5

PCM1-222, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 5,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-222	ENST00000524226	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	WDR27	A2RRH5	827 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CPED1	A4D0V7	1026 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TRIM38	O00635	465 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PLIN3	O60664	434 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SEC22B	O75396	215 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PSMG1	O95456	288 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GSTT2B	P0CG30	244 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PEPD	P12955	493 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	AGXT	P21549	392 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ADRA1B	P35368	520 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GJA8	P48165	433 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SEC24C	P53992	1094 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	USP46	P62068	366 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ABAT	P80404	500 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RIPK1	Q13546	671 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	KCNJ11	Q14654	390 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NEDD8	Q15843	81 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PYDC2	Q56P42	97 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	BEND5	Q7L4P6	421 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TAC4	Q86UU9	113 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MON1A	Q86VX9	555 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TDRP	Q86YL5	185 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SCML4	Q8N228	414 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PQLC3	Q8N755	202 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	METTL6	Q8TCB7	284 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NELL1	Q92832	810 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NACC2	Q96BF6	587 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ARL15	Q9NXU5	204 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	EMC3	Q9P0I2	261 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MATN2	O00339	956 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	AXIN1	O15169	862 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	DCX	O43602	365 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SLC25A12	O75746	678 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2	5e-7	■□□□□ 10
PCM1-222	ENST00000524226	BEST1	O76090	585 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	UBOX5	O94941	541 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	OR4Q2	P0C623	313 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CSF2RA	P15509	400 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PSMB4	P28070	264 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2	8e-7	■■■■■ 29.7
PCM1-222	ENST00000524226	TUB	P50607	506 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CLCN5	P51795	746 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PNLIPRP1	P54315	467 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ATP6V0D1	P61421	351 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RBPJ	Q06330	500 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SLC20A2	Q08357	652 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	RALGDS	Q12967	914 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	MTAP	Q13126	283 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	IL18R1	Q13478	541 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	CSHL1	Q14406	222 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	LPAL2	Q16609	132 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FUT10	Q6P4F1	479 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	FAM171B	Q6P995	826 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		2.56	□□□□□ -2
PCM1-222	ENST00000524226	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2

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