RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		3.9	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PRX	Q9BXM0	1461 aa		3.9	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		3.9	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1B0GVC2	190 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057		J3QR06	171 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GPR137B	O60478	399 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	NDUFS3	O75489	264 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CSPG5	O95196	566 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FAM157C	P0CG43	387 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ATP1A3	P13637	1013 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	WNT5A	P41221	380 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DSCR10	P59022	87 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	UBE2V1	Q13404	147 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	NAB2	Q15742	525 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ISCA2	Q86U28	154 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0J9YWU9	116 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PLK4	O00444	970 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZBTB43	O43298	467 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	EML2	O95834	649 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	NGF	P01138	241 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC3B	P05452	202 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TPO	P07202	933 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DPEP1	P16444	411 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CBL	P22681	906 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CCR9	P51686	369 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GPR143	P51810	404 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SCML4	Q8N228	414 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FRMD1	Q8N878	549 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SEMA4D	Q92854	862 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MOCOS	Q96EN8	888 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		3.88	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057		H7C423	109 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	KRT9	P35527	623 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	BMX	P51813	675 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GALC	P54803	685 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TFAP4	Q01664	338 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GTDC1	Q4AE62	458 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM198	Q66K66	360 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	HACE1	Q8IYU2	909 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	LYG1	Q8N1E2	194 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	C1orf74	Q96LT6	269 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	VGLL1	Q99990	258 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SETD4	Q9NVD3	440 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		3.87	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ARAP1	Q96P48	1450 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	CKMT2	P17540	419 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PIK3CA	P42336	1068 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	MSH2	P43246	934 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	PPARD	Q03181	441 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	LRMP	Q12912	555 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		3.86	□□□□□ -1.79
COPS5-208	ENST00000519057	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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