RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 INSL6Q9Y581 213 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF726A6NNF4 738 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 GBAP04062 536 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 STARP49675 285 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CDK16Q00536 496 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC51AQ86UW1 340 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM63Q969Q1 353 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.74□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF806P0C7X5 589 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 COX4I1P13073 169 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF823P16415 610 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 NMBRP28336 390 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TM4SF1P30408 202 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ECH1Q13011 328 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ASB2Q96Q27 587 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TPSD1Q9BZJ3 242 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 DKKL1Q9UK85 242 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 WRBO00258 174 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CASKO14936 926 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 BDKRB1P46663 353 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 BLKP51451 505 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MXD1Q05195 221 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 DGUOKQ16854 277 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 XYLT1Q86Y38 959 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 BTBD1Q9H0C5 482 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 IPPKQ9H8X2 491 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC34A8MYJ7 566 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CDC7O00311 574 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR89BP0CG08 455 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 IL7RP16871 459 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MNDAP41218 407 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CLCNKAP51800 687 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 NRG3P56975 720 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CHIT1Q13231 466 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 AMZ2Q86W34 360 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MREGQ8N565 214 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 OXR1Q8N573 874 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAAF1Q8NEP3 725 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMA8Q8TAA3 256 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 DHRS7Q9Y394 339 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TAF4O00268 1085 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TMCC2O75069 709 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC22A3O75751 556 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 FGF18O76093 207 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ECT2LQ008S8 904 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PARP15Q460N3 678 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CARD17Q5XLA6 110 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 FZD3Q9NPG1 666 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 COL20A1Q9P218 1284 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MYRFQ9Y2G1 1151 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM150CB9EJG8 249 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MUSKO15146 869 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMTOR5O43504 91 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 SERPINA3P01011 423 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ITGA2P17301 1181 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CHRNA4P43681 627 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH4P55283 916 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 DLG1Q12959 904 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 GRM3Q14832 879 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 MBLAC2Q68D91 279 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 LIN54Q6MZP7 749 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM192Q8IY95 271 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.73□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ITGA1P56199 1179 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ABATP80404 500 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 SMCO1Q147U7 214 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 INAVAQ3KP66 663 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 LIPMQ5VYY2 423 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 NUP50Q9UKX7 468 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CORO2BQ9UQ03 480 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.72□□□□□ -0.53
UBASH3B-201ENST00000284273 CYB5AP00167 134 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms