RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NJY4 79 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PRRG1O14668 218 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 RAD51BO15315 384 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 GJB3O75712 270 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 GJB5O95377 273 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 NPPAP01160 153 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL10P02778 98 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 SOD2P04179 222 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 URODP06132 367 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 GPIP06744 558 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 FURINP09958 794 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ARAFP10398 606 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 MTHFD2P13995 350 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRM3P20309 590 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 IL10P22301 178 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 EPHB3P54753 998 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CDH13P55290 713 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-8P63133 956 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A2Q01362 244 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CRY1Q16526 586 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF220Q5VTB9 566 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PAOXQ6QHF9 649 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 NLRP8Q86W28 1048 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 RBFAQ8N0V3 343 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CARNMT1Q8N4J0 409 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC30BQ8N4P2 665 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PAF1Q8N7H5 531 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF461Q8TAF7 563 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CD200R1Q8TD46 325 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF21Q96ID5 467 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 EXOC2Q96KP1 924 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PKP2Q99959 881 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 HGH1Q9BTY7 390 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CLPBQ9H078 707 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 AIG1Q9NVV5 245 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 LHX3Q9UBR4 397 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CD300AQ9UGN4 299 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 APPL1Q9UKG1 709 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PCTPQ9UKL6 214 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PP18 115 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM234BA2RU67 622 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK2AP1O14519 115 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TBL1XO60907 577 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 SOCS5O75159 536 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6AP2O75787 350 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 ABLIM3O94929 683 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 EFEMP2O95967 443 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF6O95976 241 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 OTCP00480 354 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PRLP01236 227 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 CYBBP04839 570 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR35P0CG20 571 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PCSK2P16519 638 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMC3P17980 439 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPAN8P19075 237 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 MSH3P20585 1137 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 RGRP47804 291 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNC1P48547 511 aa9.09□□□□□ -0.95
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3CGP48736 1102 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms