RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 IVDP26440 423 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CD1CP29017 333 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC19A1P41440 591 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGEA6P43360 314 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MAPK9P45984 424 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 HHEXQ03014 270 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ACVR1Q04771 509 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf54Q08AI8 447 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SPIDRQ14159 915 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CLCA4Q14CN2 919 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 BRD3Q15059 726 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 METRNLQ641Q3 311 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PIM3Q86V86 326 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 JAMLQ86YT9 394 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNJLQ8IV13 435 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2L2Q8NH16 312 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SLCO2A1Q92959 643 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.345e-11■■■■■ 94.1
EFTUD2-211ENST00000588374 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PWWP2AQ96N64 755 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC1Q99614 292 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC38A3Q99624 504 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KIFC1Q9BW19 673 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 WWP1Q9H0M0 922 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RDH14Q9HBH5 336 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SOX13Q9UN79 622 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX24Q9Y343 169 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 AK5Q9Y6K8 562 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.68□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0G2JNG1 304 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 A6NCN8 305 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MU76 341 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ZW10O43264 779 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFS3O75489 264 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 BANF1O75531 89 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 OR56A5P0C7T3 313 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 BRAFP15056 766 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGB6P18564 788 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MPSTP25325 297 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 HALP42357 657 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 NSG1P42857 185 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ITGA8P53708 1063 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP4F3Q08477 520 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMK2BQ13554 666 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KRT33BQ14525 404 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 KIR2DS5Q14953 304 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RPE65Q16518 533 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ISXQ2M1V0 245 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 BBS9Q3SYG4 887 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL7AQ4VC05 210 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 MSS51Q4VC12 460 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SPRED1Q7Z699 444 aa6.67□□□□□ -1.34
EFTUD2-211ENST00000588374 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms