RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549302.1

ARL1-206, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 1, human

TSL 3

Gene ARL1, Length 725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL1-206	ENST00000549302	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PDE7B	Q9NP56	450 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	NT5M	Q9NPB1	228 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CASS4	Q9NQ75	786 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ACSS2	Q9NR19	701 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		9.49	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SDK2	Q58EX2	2172 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	GRID2	O43424	1007 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SPAG6	O75602	509 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ATP1A3	P13637	1013 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF28	P17035	718 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MIP	P30301	263 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	STC1	P52823	247 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	OGDH	Q02218	1023 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MAMLD1	Q13495	774 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SEMA5A	Q13591	1074 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DPYS	Q14117	519 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	KRT31	Q15323	416 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TMEM135	Q86UB9	458 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	COX14	Q96I36	57 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	GPR87	Q9BY21	358 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	UCK1	Q9HA47	277 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302		A0A0J9YYE9	177 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302		A0A0U1RQS6	177 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	EPHB6	O15197	1021 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MAFK	O60675	156 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DNAJC6	O75061	913 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SEMA7A	O75326	666 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	DNAJB5	O75953	348 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TRBC1	P01850	177 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	C9	P02748	559 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	FER	P16591	822 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CCL11	P51671	97 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	GFER	P55789	205 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PTPRR	Q15256	657 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	INSC	Q1MX18	579 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	BOLA3	Q53S33	107 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	IRGC	Q6NXR0	463 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	FDX2	Q6P4F2	183 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PGBD5	Q8N414	524 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	HSPH1	Q92598	858 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	PEBP4	Q96S96	227 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	AGAP2	Q99490	1192 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CARD9	Q9H257	536 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	ACTL8	Q9H568	366 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	LHX9	Q9NQ69	397 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	KLC4	Q9NSK0	619 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	RARRES3	Q9UL19	164 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		9.47	□□□□□ -0.89
ARL1-206	ENST00000549302	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	NUAK1	O60285	661 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	DPM1	O60762	260 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	CLDN7	O95471	211 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	PEX11B	O96011	259 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	B3GALT4	O96024	378 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	PDHA1	P08559	390 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	FGF5	P12034	268 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	PTPN4	P29074	926 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	PCK1	P35558	622 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	PREP	P48147	710 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ARL1-206	ENST00000549302	CLCNKA	P51800	687 aa		9.46	□□□□□ -0.9

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