RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ARSFP54793 590 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CRY1Q16526 586 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 LPCAT1Q8NF37 534 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CRISPLD1Q9H336 500 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ACTL8Q9H568 366 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 UPK1AO00322 258 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CAPN1P07384 714 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CR2P20023 1033 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ELK4P28324 431 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 IL27RAQ6UWB1 636 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD36A6QL64 1941 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 E5RI56 91 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 AAK1Q2M2I8 961 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TERB1Q8NA31 727 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNJ9Q92806 393 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SCUBE2Q9NQ36 999 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 HEBP1Q9NRV9 189 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PFDN6O15212 129 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PCNAP12004 261 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CD9P21926 228 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 HMOX2P30519 316 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ALDH3A2P51648 485 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNA10Q16322 511 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 C5orf22Q49AR2 442 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM117BQ6P1L5 589 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ITIH5Q86UX2 942 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM126BQ8IXS8 530 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CGREF1Q99674 301 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 IQCF5A8MTL0 148 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD66B4E2M5 251 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TULP3O75386 442 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 EOMESO95936 686 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 HTR6P50406 440 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 DGKQP52824 942 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 OXCT1P55809 520 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 RPS24P62847 133 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PTPRRQ15256 657 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PRR23BQ6ZRT6 265 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ITFG1Q8TB96 612 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TMBIM1Q969X1 311 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TUBA1CQ9BQE3 449 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0U1RQS6 177 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM64BA6NI03 449 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ARNTLO00327 626 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SYN3O14994 580 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ALPLP05186 524 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 TCF3P15923 654 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CD247P20963 164 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CTGFP29279 349 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PLIN5Q00G26 463 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKDD1AQ495B1 522 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP20A1Q6UW02 462 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 KDELR3O43731 214 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS23O95084 383 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 RAP2AP10114 183 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 CLCN4P51793 760 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 EFHBQ8N7U6 833 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 RAI2Q9Y5P3 530 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 ST14Q9Y5Y6 855 aa26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-221ENST00000511747 LSM1O15116 133 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 Q6ZNX1 250 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 STK32CQ86UX6 486 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC4FQ8N1N0 589 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 PDPRQ8NCN5 879 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D15Q8TC07 691 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 H3BNC9 293 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD28O15084 1053 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 STX7O15400 261 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 ACSL4O60488 711 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 NR6A1Q15406 480 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 AP5B1Q2VPB7 878 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF773Q6PK81 442 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 XKR5Q6UX68 686 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R14BQ96C90 147 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.861e-6■■■■□ 23.8
SH3BP2-221ENST00000511747 ING2Q9H160 280 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 GREB1Q4ZG55 1949 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTS4O75173 837 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-221ENST00000511747 CPNE6O95741 557 aa26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms