RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	CTBS	Q01459	385 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRP8	Q14114	963 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	KYNU	Q16719	465 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PYCR3	Q53H96	274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCID2	Q5JVF3	399 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARMC3	Q5W041	872 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CES3	Q6UWW8	571 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	AGAP2	Q99490	1192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	STRADB	Q9C0K7	418 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RMI1	Q9H9A7	625 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	THSD1	Q9NS62	852 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	BFAR	Q9NZS9	450 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	SATB2	Q9UPW6	733 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZZEF1	O43149	2961 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PQM1	296 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	INPP4B	O15327	924 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RIPK2	O43353	540 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TTC4	O95801	387 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PGAM1	P18669	254 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	SSTR1	P30872	391 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ACTR1B	P42025	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDX1	P52945	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PMS2	P54278	862 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ACTR1A	P61163	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CBX1	P83916	185 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	BIRC2	Q13490	618 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CRYM	Q14894	314 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPRED1	Q7Z699	444 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRIM74	Q86UV6	250 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM74	Q96NL1	305 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	IL17C	Q9P0M4	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CHD6	Q8TD26	2715 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC78	A2IDD5	438 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	HEATR9	A2RTY3	570 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCL22	O00626	93 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	USP1	O94782	785 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	GPR89B	P0CG08	455 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCKBR	P32239	447 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	CA5A	P35218	305 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SCAMP4-208	ENST00000489554	HMGCL	P35914	325 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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