RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 HOXC8P31273 242 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 GRIA3P42263 894 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CCR10P46092 362 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CXCR3P49682 368 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 NPY4RP50391 375 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CCT8P50990 548 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CCR3P51677 355 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 SLMAPQ14BN4 828 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 DLG2Q15700 870 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 LETM2Q2VYF4 491 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 PCGF3Q3KNV8 242 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 COLEC12Q5KU26 742 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ACSM2BQ68CK6 577 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 LCTLQ6UWM7 567 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 VRK3Q8IV63 474 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 XXYLT1Q8NBI6 393 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 PTERQ96BW5 349 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 HIPK3Q9H422 1215 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CARD8Q9Y2G2 431 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.66□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 A6NL46 340 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPB2A8KAH6 182 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 C19orf81C9J6K1 198 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 KLRF2D3W0D1 207 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 H0YAE9 185 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 FYNP06241 537 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ST6GAL1P15907 406 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 DRD4P21917 467 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 KLRC2P26717 231 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 MCM7P33993 719 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 KRT2P35908 639 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 HNF4AP41235 474 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 BPIFB3P59826 476 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 PKP1Q13835 747 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 SHBQ15464 509 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 NAB2Q15742 525 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 HSPB2Q16082 182 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 CST9LP1Q5W188 147 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 VSTM1Q6UX27 236 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 TC2NQ8N9U0 490 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 RASSF8Q8NHQ8 419 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM151AQ8WW52 585 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 PTP4A1Q93096 173 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM68Q96MH6 324 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 TM2D2Q9BX73 214 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR88Q9GZN0 384 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 GDE1Q9NZC3 331 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 AMACRQ9UHK6 382 aa5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
STRADBP1-201ENST00000478954 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.65□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 WIPF3A6NGB9 483 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC72A6NJI9 287 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 EBAG9O00559 213 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 MSI1O43347 362 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 MBTPS2O43462 519 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 PGK1P00558 417 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 TPOP07202 933 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 PROS1P07225 676 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 FDPSP14324 419 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 ACADLP28330 430 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP6V1E1P36543 226 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 GDF5P43026 501 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 CENPAP49450 140 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 HMGCS2P54868 508 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 ECT2LQ008S8 904 aa5.64□□□□□ -1.51
STRADBP1-201ENST00000478954 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
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