RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 OLFM1Q99784 485 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC77Q9BR77 488 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GNPTGQ9UJJ9 305 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS38A1L453 326 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL33A6NCF5 533 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PATE3B3GLJ2 98 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NIPSNAP2O75323 286 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RFPL1O75677 317 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT38O76015 456 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TSPAN12O95859 305 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 RALBP11234 206 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ENGP17813 658 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP5DP30049 168 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 AKT1P31749 480 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PLA2G5P39877 138 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CCNFP41002 786 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CTSKP43235 329 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 BLKP51451 505 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CDKN2DP55273 166 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TAS2R39P59534 338 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 POU4F1Q01851 419 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GRIK2Q13002 908 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ALG11Q2TAA5 492 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 INAVAQ3KP66 663 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PYCR3Q53H96 274 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PARGQ86W56 976 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP4X1Q8N118 509 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CD200R1Q8TD46 325 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NDNQ99608 321 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 EDEM2Q9BV94 578 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CLPBQ9H078 707 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2AG1Q9H205 316 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CAPN10Q9HC96 672 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MKS1Q9NXB0 559 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CDYLQ9Y232 598 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CRYL1Q9Y2S2 319 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 A6NCN8 305 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GPC4O75487 556 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT37O76014 449 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CDK14O94921 469 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ASMTLO95671 621 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MSH3P20585 1137 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 AOAHP28039 575 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC26A3P40879 764 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SLCO1A2P46721 670 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINB8P50452 374 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CCT8P50990 548 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CLCNKAP51800 687 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.938e-7■■■■□ 22.2
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP8P85298 464 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 BMPR2Q13873 1038 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GTF2H3Q13889 308 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 LRP8Q14114 963 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF19Q2TAC6 998 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 LAYNQ6UX15 382 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CLEC14AQ86T13 490 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TRABD2AQ86V40 505 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 PIM3Q86V86 326 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP97Q8IW35 865 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DCLK2Q8N568 766 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 GDAP1Q8TB36 358 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 NAT14Q8WUY8 206 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TCEAL3Q969E4 200 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 TLCD1Q96CP7 247 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 SGF29Q96ES7 293 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-207ENST00000454947 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms