RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BBS9Q3SYG4 887 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCL7AQ4VC05 210 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HS1BP3Q53T59 392 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPRED1Q7Z699 444 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT222Q8N1A0 295 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SFRP1Q8N474 314 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARL14Q8N4G2 192 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAPK15Q8TD08 544 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ULK4Q96C45 1275 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COPS8Q99627 209 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RMI1Q9H9A7 625 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BFARQ9NZS9 450 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PKD1L2Q7Z442 2459 aa9.25□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KRT87PA6NCN2 255 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OPA1O60313 960 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VAPBO95292 243 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDHA2P29803 388 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC1A2P43004 574 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NPY2RP49146 381 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP1CAP62136 330 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDK16Q00536 496 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PDE1BQ01064 536 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFHR1Q03591 330 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRP8Q14114 963 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRYMQ14894 314 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BRD3Q15059 726 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCNJLQ8IV13 435 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR4L1Q8NH43 312 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM136AQ96C01 138 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFAP36Q96G28 342 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNF8Q96H20 258 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WWP1Q9H0M0 922 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.24□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 D6RAR5 112 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NIPSNAP2O75323 286 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PIAS1O75925 651 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C1QTNF9P0C862 333 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MLNP12872 115 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 F3P13726 295 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MPSTP25325 297 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC19A1P41440 591 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ELK3P41970 407 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAPK9P45984 424 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CLCNKAP51800 687 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PGGT1BP53609 377 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DMPKQ09013 629 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MORF4L2Q15014 288 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 AMZ1Q400G9 498 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPR33Q49SQ1 333 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DUPD1Q68J44 220 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PACS1Q6VY07 963 aa9.23□□□□□ -0.93
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CENPUQ71F23 418 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms