RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM136AQ96C01 138 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR27Q9NS67 375 aa16.68■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPTFQ12830 3046 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM202A6NGA9 273 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR33A8MZF0 331 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KMOO15229 486 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRID2O43424 1007 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TYROBPO43914 113 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBSLP0DN79 551 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 AOAHP28039 575 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD38P28907 300 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRHR1P34998 444 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBSP35520 551 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC18A1P54219 525 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL2P60568 153 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANGPT1Q15389 498 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PMS2CLQ68D20 193 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC14AQ86T13 490 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF547Q8IVP9 402 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR13H1Q8NG92 308 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAT14Q8WUY8 206 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC6A18Q96N87 628 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALPQ9UBC7 116 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIOO75962 3097 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 VCANP13611 3396 aa16.67■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRSS38A1L453 326 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR37L1O60883 481 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNJ13O60928 360 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 POP7O75817 140 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL2O95198 593 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOA4P06727 396 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SP9P0CG40 484 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC166P0CW27 439 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 THEGLP0DJG4 465 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CREB1P16220 341 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITGB6P18564 788 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 DGKAP23743 735 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCR7P32248 378 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 HPDP32754 393 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGS4P49798 205 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYSMD4Q5XG99 296 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2L2Q8NH16 312 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELMO1Q92556 727 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC30A3Q99726 388 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNK9Q9NPC2 374 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC189A1A4V9 331 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM86C2PA6NEL3 165 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGAT4DA6NG13 374 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TM9SF1O15321 606 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 HRO43593 1189 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG7O75391 227 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 NR1D1P20393 614 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGGT1BP53609 377 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V0D1P61421 351 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP2R2AP63151 447 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 IRF9Q00978 393 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GBX1Q14549 363 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLC3Q6P597 504 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 ENPP7Q6UWV6 458 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMZ2Q86W34 360 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TOP3BP1-201ENST00000420768 OXR1Q8N573 874 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms