RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ufm1P61961 85 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itga7Q61738 1179 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Angptl1Q640P2 490 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zzz3Q6KAQ7 910 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm2163Q6PCY5 473 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnih3Q6ZWS4 160 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Polr2eQ80UW8 210 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 D3Ertd751eQ8BGN2 192 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Noc4lQ8BHY2 516 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr22Q8BZL4 432 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp940Q8R2Q3 566 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kat8Q9D1P2 458 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem80Q9D3H0 123 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 2010109A12RikQ9D875 119 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DguokQ9QX60 277 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PnckQ9QYK9 343 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp973A2BE20 318 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r27D3YUK6 857 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10720D3Z1I5 223 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stmn3O70166 180 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PdgfrbP05622 1098 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gjb1P28230 283 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Galnt3P70419 633 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem173Q3TBT3 378 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TceancQ3US16 359 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tusc1Q673H1 205 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gja6Q6S5G4 283 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adam39Q7M762 756 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pyhin1Q8BV49 420 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pex5lQ8C437 567 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8CDN1 933 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klf11Q8K1S5 502 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr801Q8VEU1 318 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adgre4Q91ZE5 689 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mat2bQ99LB6 334 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scd3Q99PL7 359 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AasdhpptQ9CQF6 309 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc40Q9CRC8 602 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pfdn1Q9CWM4 122 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930524N10RikQ9D519 233 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LrgukQ9D5S7 820 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ift22Q9DAI2 185 aa9.84□□□□□ -0.83
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp992B1ASD8 573 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptch2O35595 1182 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CfhP06909 1234 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tgfb3P17125 410 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt2Q3TTY5 707 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr162Q3UN16 588 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp658Q5PPQ4 887 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Six3Q62233 333 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep78Q6IRU7 790 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gxylt2Q810K9 444 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp991Q8R1N3 573 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr356Q8VFP5 315 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mark1Q8VHJ5 795 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hdac11Q91WA3 347 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GlyatQ91XE0 296 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Desi1Q9CQT7 168 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P33monoxQ9DBN4 303 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CenpkQ9ESN5 271 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmeff2Q9QYM9 374 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Carm1Q9WVG6 608 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itga8A2ARA8 1062 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8113E0CXS8 587 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 5830473C10RikF8VQ07 620 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r88L7N1W8 857 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6309L7N481 315 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 St3gal5O88829 414 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SgcdP82347 289 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dab1P97318 588 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mc1rQ01727 315 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem181aQ3U3W2 474 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdk10Q3UMM4 360 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcdc2Q5DU00 475 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klra2Q60660 288 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr845Q7TRG2 312 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ankrd45Q810N6 248 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FicdQ8BIX9 458 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GrpQ8R1I2 146 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr695Q8VFM3 315 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox4i2Q91W29 172 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kbtbd12Q9D618 625 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2c55Q9D816 490 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mettl15Q9DCL4 406 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr63Q9EQQ3 425 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tm9sf3Q9ET30 587 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nt5cQ9JM14 200 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Egfl7Q9QXT5 275 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcne5Q9QZ26 143 aa9.83□□□□□ -0.84
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efcab12V9GXH0 673 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.3 ms