RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn7Q9Z261 211 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apol7bB1AQP7 369 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r169L7N275 304 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21962L7N280 338 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdlim1O70400 327 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo1aO88329 1043 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vipr2P41588 437 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GemP55041 295 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tubgcp3P58854 905 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UtyP79457 1212 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atf4Q06507 349 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uri1Q3TLD5 531 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam131bQ3TY60 332 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Skap2Q3UND0 358 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bpifb5Q3UQ05 490 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apol7eQ3UZ24 369 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taar7fQ5QD08 358 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taar7dQ5QD10 358 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ChukQ60680 745 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brinp2Q6DFY8 783 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AstlQ6HA09 435 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Avl9Q80U56 649 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dyrk4Q8BI55 632 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phc3Q8CHP6 981 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Esrp2Q8K0G8 717 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt2b34Q8K154 532 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcyt2Q922E4 404 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnk1Q99ML2 666 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcam1Q99NB3 548 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt17Q9CWD3 296 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim44Q9QXA7 346 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdcd1lg2Q9WUL5 247 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dock4P59764 1978 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nbeal1E9PYP2 2688 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fndc7A2AED3 737 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gbp4A4UUI3 631 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl9F7BE40 171 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jmjd7P0C872 316 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt19P19001 403 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akt1P31750 480 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lzts1P60853 599 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnab2P62482 367 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rps3P62908 243 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt86P97861 486 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabpb1Q00420 383 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrxosQ3UL53 246 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ElaneQ3UP87 265 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lipo3Q3UT41 399 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kirrel2Q7TSU7 700 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtmr12Q80TA6 747 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CpmQ80V42 443 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itln1bQ80ZA0 313 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rufy1Q8BIJ7 712 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tyw1Q8BJM7 721 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lats1Q8BYR2 1129 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr26Q8BZA7 337 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a16Q8C0K5 332 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dclre1bQ8C7W7 541 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc159Q8C963 411 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc36a1Q8K4D3 475 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GrpQ8R1I2 146 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r219Q8R271 312 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc61Q8R2R5 259 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Blzf1Q8R2X8 403 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gle1Q8R322 699 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr448Q8VES9 310 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc42ep1Q91W92 409 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ogfod2Q9CQ04 349 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bud23Q9CY21 281 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan17Q9D7W4 270 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rcan3Q9JKK0 239 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nme3Q9WV85 169 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RgrQ9Z2B3 291 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trank1Q8BV79 2999 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp352A2AML7 551 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CerklA2AQH1 525 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lekr1B2RVN1 116 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp871G5E905 615 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2056J3QQ02 144 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrymO54983 313 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hcn2O88703 863 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atxn10P28658 475 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pola2P33611 600 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plin2P43883 425 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PltpP55065 493 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlx5P70396 289 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Casp3P70677 277 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Teddm2Q208S0 260 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AccslQ3UX83 580 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Marveld2Q3UZP0 555 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa10.97□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ZpbpQ62522 350 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.4 ms