RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 CD151P48509 253 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 NXPH1P58417 271 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-211ENST00000626236 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-211ENST00000626236 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-211ENST00000626236 CTSCP53634 463 aa8.39□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 GRTP1Q5TC63 336 aa8.39□□□□□ -1.07
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SGMS1-211ENST00000626236 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 KRT222Q8N1A0 295 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-211ENST00000626236 GPATCH11Q8N954 259 aa8.39□□□□□ -1.07
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