RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 MC1RQ01726 317 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 GDAP1Q8TB36 358 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 CXorf40BQ96DE9 158 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCDC42Q96M95 316 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.41■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 NFKB1P19838 968 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 CDKN2BP42772 138 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC1A1P43005 524 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 WASHC5Q12768 1159 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 GTF2H3Q13889 308 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 LLGL1Q15334 1064 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 KDELC1Q6UW63 502 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRSS42Q7Z5A4 293 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 ABHD17AQ96GS6 310 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 ELMO2Q96JJ3 720 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM153AQ9UHL3 310 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 CROTQ9UKG9 612 aa20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC3-208ENST00000616074 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR39O43194 453 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CBFA2T2O43439 604 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 MFAP3LO75121 409 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA0754O94854 1291 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NDUFA10O95299 355 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 VCLP18206 1134 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 COMTP21964 271 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 DLSTP36957 453 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NR2C2P49116 596 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 WNT3AP56704 352 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL11RAQ14626 422 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TAZQ16635 292 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IRGCQ6NXR0 463 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL26Q9NPH9 171 aa20.39■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 F5H423 210 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPOPO43791 374 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CST8O60676 142 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CA5AP35218 305 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPAM1P38567 509 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CASRP41180 1078 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHRNA4P43681 627 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 PPP1CAP62136 330 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADCY2Q08462 1091 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KAZNQ674X7 775 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 VSTM4Q8IW00 320 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR150Q8NGU9 434 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TTC25Q96NG3 672 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRABDQ9H4I3 376 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANAPC2Q9UJX6 822 aa20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A9O60656 530 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TPM1P09493 284 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FGF5P12034 268 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A6P19224 532 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A1P22309 533 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A4P22310 534 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 HALP42357 657 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CTSCP53634 463 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TFDP2Q14188 446 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCEAL1Q15170 157 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHRNA6Q15825 494 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 COLEC12Q5KU26 742 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB33BQ9H082 229 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 IL17CQ9P0M4 197 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.37■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 NAV2Q8IVL1 2488 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms